Секвенирование генома пшеницы.
ВНИИСБ контролируют гены твердой пшеницы!
Год начался с прекрасных новостей. ВНИИ сельскохозяйственной биотехнологии получен патент на изобретение «Способ одновременного нанопорового секвенирования полных последовательностей значимых генов твердой пшеницы».
Секвенирование генома пшеницы относится к области биотехнологии и селекции растений, а именно к способу одновременного секвенирования нуклеотидных последовательностей панели генов, лежащих в основе важных для селекционного процесса признаков твердой пшеницы.
Секвенирование генома пшеницы, зачем это надо?
Мы едим пшеницу, картофель, свеклу, не задумываясь над названием сортов. И обращаем на это внимание, только если сами занимаемся огородничеством, выбираем сорт моркови или томатов для выращивания. Между тем, происходит постоянная битва за урожай, которая невозможна без совершенствования того, что называется генотипом сорта. Урожайность, вкус, размер плода — на все это влияют гены и окружающая среда.
Для того, чтобы грамотно выстроить защиту растений от различных болезней, от засухи, заморозков и других стрессов, необходимо знать детально те гены и их взаимодействия, которые приводят к формированию устойчивости растений к различным видам стресса. И тут нам помощь приходит метод секвенирования.
И тут нам помощь приходит метод секвенирования ДНК и РНК — это рутинный процесс, позволяющий, тем не менее, вникнуть в суть всего живого. Постепенное развитие и распространение этой методики благоприятно сказалось на пищевой отрасли, в частности, для исследования социально значимых продуктов сельского хозяйства.
Секвенирование генома пшеницы включает в себя следующие этапы: выделение высокомолекулярной фракции ДНК из 4-дневных проростков твердой пшеницы (HMW DNA), обогащение геномной ДНК высокомолекулярными фрагментами; проектирование гРНК, специфичных для значимых генов твердой пшеницы, и синтез гРНК in vitro на молекуле двуцепочечной ДНК-матрицы, сборку рибонуклеопротеиновых комплексов Cas9/гРНК, Cas9-целевое нанопоровое секвенирование, биоинформатический анализ полученных данных — сборка и выравнивание на геном.
Источник информации http://www.vniisb.ru/